Ce Cichlidé géant est endémique du lac Tanganyika, présent au Burundi, en Tanzanie, en Zambie et en République démocratique du Congo ; il fréquente les zones profondes, les pentes rocheuses, les fonds sableux et les eaux claires entre 10 et 60 m de profondeur, où il chasse activement d’autres poissons, notamment les sardines du Tanganyika du genre Limnothrissa et Stolothrissa.

Boulengerochromis microlepis est un prédateur solitaire, territorial, actif surtout à l’aube et au crépuscule ; la reproduction est ovipare, avec des couples formés temporairement, les œufs étant déposés sur des substrats rocheux ou sableux ; les parents assurent une garde biparentale, protégeant les œufs puis les alevins, un comportement typique des grands cichlidés du Tanganyika, comparable à celui des Boulengerochromis.

Ce Cichlidé géant est un piscivore strict, se nourrissant principalement de poissons pélagiques et littoraux, notamment les sardines du lac, les juvéniles d’autres cichlidés et parfois de petits crustacés ; sa mâchoire puissante et sa vitesse de pointe en font un chasseur redoutable, occupant la niche écologique de super‑prédateur.

Les adultes n’ont presque aucun prédateur naturel, hormis de très grands poissons comme certains Lates du Tanganyika ou de rares crocodiles dans les zones littorales ; les juvéniles sont vulnérables aux cichlidés piscivores, aux Lates, aux oiseaux piscivores et aux serpents aquatiques, mais la mortalité naturelle reste faible comparée à la pression humaine.

Boulengerochromis microlepis est classé Quasi menacé (NT) par l’UICN, avec une tendance au déclin liée à la surpêche, à la pression commerciale, à la dégradation de l’habitat et à la compétition avec les pêcheries industrielles du Tanganyika ; les effectifs exacts sont inconnus mais estimés à quelques dizaines de milliers d’individus, avec une forte diminution des grands adultes, essentiels à la reproduction, ce qui fragilise la dynamique de population de Boulengerochromis microlepis.